Tijekom pontifikata pape Franje osnovana je Mješovita komisija sastavljena od hrvatskih katoličkih i srpskih pravoslavnih stručnjaka, s ciljem zajedničkog proučavanja lika kardinala Alojzija Stepinca. Pod vodstvom oca Bernarda Ardure, predsjednika Papinskog vijeća za povijesne znanosti, članovi Komisije sastali su se 12. i 13. srpnja 2017. u Domu Svete Marte u Vatikanu.
U zajedničkom priopćenju istaknuto je da je njihov rad doprinio boljem razumijevanju povijesnih okolnosti između Prvoga svjetskog rata i 1960., godine smrti kardinala Stepinca. Također su dodatno rasvijetljeni život i služenje kardinala Stepinca kao istaknutog katoličkog pastira u izazovnom povijesnom razdoblju. Komisija je zaključila da različiti događaji, govori, spisi, šutnje i stajališta i dalje izazivaju različita tumačenja. Tumačenja kardinalova života, kako među katoličkim Hrvatima, tako i među pravoslavnim Srbima, ostaju raznolika, priopćeno je nakon završetka rada Komisije.
Nadalje, 7. svibnja 2019., tijekom povratka iz trodnevnog posjeta Bugarskoj i Sjevernoj Makedoniji, papa Franjo je u razgovoru s novinarima u zrakoplovu izjavio da ga, kada je riječ o kanonizaciji Stepinca, prvenstveno zanima istina.
"Povijesni slučaj je ovaj: kanonizacija Stepinca. On je bio krepostan čovjek, zato ga je Crkva proglasila blaženim. Vjernici mu se mogu moliti. Ali u jednom trenutku procesa došlo se do nerazjašnjenih točaka koje se tiču povijesti. I ja, koji moram potpisati kanonizaciju – to je, naime, moja zadaća – moleći, razmišljajući i tražeći savjet, uvidio sam da moram zamoliti za pomoć srpskog patrijarha Irineja, koji je veliki patrijarh. I Irinej mi je pomogao. Zajedno smo osnovali povijesnu komisiju: i njega i mene jedina stvar koja zanima je ne pogriješiti, zanima nas istina. Ne pogriješiti. Čemu služi jedna izjava o svetosti, ako nije jasna istina. Ne služi nikom. Znamo da je (Stepinac op.a.) dobar čovjek, da je blaženik, ali da se učini ovaj korak ja sam tražio pomoć Irineja da sve bude po istini. Izučava se. Najprije je osnovana komisija koja je dala svoje mišljenje. Ali sada se izučavaju druge točke. Dublje se proučavaju neke točke kako bi istina bila jasna. Ja se ne plašim istine. Ne plašim se. Samo se plašim suda Božjeg. Hvala", rekao je papa o Stepinčevoj kanonizaciji.
